Reakcje PCR prowadzono w warunkach opisanych w podrozdziale 3.9.9. Mieszaninę PCR poddawano trawieniu enzymem DpnI desery w celu strawienia matrycowego ciasteczka przepisy DNA. Następnie analizowano elektroforetycznie, wycinano z żelu fragment odpowiadający powielonej kasecie delecyjnej i oczyszczano stosując zestaw zupy przepisy QIAquick PCR Purification Kit.